中国科学院大学（简称“中科院”）与中国科学院下属的研究所共同培养研究生，并颁发学位证书，这些研究所包括：
1、中国科学技术大学（简称“中科大”或“CSK”）
2、中国科学院物理研究所
3、中国科学院化学研究所
4、中国科学院生物物理研究所
5、中国科学院数学与系统科学研究所
6、中国科学院地球与空间科学中心
7、中国科学院电子学研究所
8、中国科学院软件研究所
9、中国科学院自动化研究所
10、中国科学院信息工程研究所
11、中国科学院人工智能研究所
12、中国科学院技术科学研究院
13、中国科学院半导体研究所
14、中国科学院生态环境研究中心
15、中国科学院国家天文台
16、中国科学院地质与地球物理研究所
17、中国科学院遥感与数字地球研究所
18、中国科学院城市环境研究所
19、中国科学院能源研究所
20、中国科学院过程工程研究所
21、中国科学院微电子研究所
22、中国科学院软件与微电子学院
23、中国科学院计算技术研究所
24、中国科学院大学生命科学学院
25、中国科学院大学信息科学与技术学院
26、中国科学院大学电子工程与信息科学学院
27、中国科学院大学材料科学与工程学院
28、中国科学院大学计算机科学与技术学院
29、中国科学院大学化学与化工学院
30、中国科学院大学机械与运载工程学院
31、中国科学院大学光电科学与工程学院
32、中国科学院大学生命科学学院
33、中国科学院大学物理电子学院
34、中国科学院大学信息与通信工程学院
35、中国科学院大学环境科学与工程学院
36、中国科学院大学核科学与技术学院
37、中国科学院大学材料科学与工程学院
38、中国科学院大学化学与化工学院
39、中国科学院大学机械与运载工程学院
40、中国科学院大学光电科学与工程学院
41、中国科学院大学生命科学学院
42、中国科学院大学物理电子学院
43、中国科学院大学信息与通信工程学院
44、中国科学院大学环境科学与工程学院
45、中国科学院大学核科学与技术学院
46、中国科学院大学材料科学与工程学院
47、中国科学院大学化学与化工学院
48、中国科学院大学机械与运载工程学院
49、中国科学院大学光电科学与工程学院
50、中国科学院大学生命科学学院
51、中国科学院大学物理电子学院
52、中国科学院大学信息与通信工程学院
53、中国科学院大学环境科学与工程学院
54、中国科学院大学核科学与技术学院
55、中国科学院大学材料科学与工程学院
56、中国科学院大学化学与化工学院
57、中国科学院大学机械与运载工程学院
58、中国科学院大学光电科学与工程学院
59、中国科学院大学生命科学学院
60、中国科学院大学物理电子学院
61、中国科学院大学信息与通信工程学院
62、中国科学院大学环境科学与工程学院
63、中国科学院大学核科学与技术学院
64、中国科学院大学材料科学与工程学院
65、中国科学院大学化学与化工学院
66、中国科学院大学机械与运载工程学院
67、中国科学院大学光电科学与工程学院
68、中国科学院大学生命科学学院
69、中国科学院大学物理电子学院
70、中国科学院大学信息与通信工程学院
71、中国科学院大学环境科学与工程学院
72、中国科学院大学核科学与技术学院
73、中国科学院大学材料科学与工程学院
74、中国科学院大学化学与化工学院
75、中国科学院大学机械与运载工程学院
76、中国科学院大学光电科学与工程学院
77、中国科学院大学生命科学学院
78、中国科学院大学物理电子学院
79、中国科学院大学信息与通信工程学院
80、中国科学院大学环境科学与工程学院
81、中国科学院大学核科学与技术学院
82、中国科学院大学材料科学与工程学院
83、中国科学院大学化学与化工学院
84、中国科学院大学机械与运载工程学院
85、中国科学院大学光电科学与工程学院
86、中国科学院大学生命科学学院
87、中国科学院大学物理电子学院
88、中国科学院大学信息与通信工程学院
89、中国科学院大学环境科学与工程学院
90、中国科学院大学核科学与技术学院
91、中国科学院大学材料科学与工程学院
92、中国科学院大学化学与化工学院
93、中国科学院大学机械与运载工程学院
94、中国科学院大学光电科学与工程学院
95、中国科学院大学生命科学学院
96、中国科学院大学物理电子学院
97、中国科学院大学信息与通信工程学院
98、中国科学院大学环境科学与工程学院
99、中国科学院大学核科学与技术学院
100、中国科学院大学材料科学与工程学院
101、中国科学院大学化学与化工学院
102、中国科学院大学机械与运载工程学院
103、中国科学院大学光电科学与工程学院
104、中国科学院大学生命科学学院
105、中国科学院大学物理电子学院
106、中国科学院大学信息与通信工程学院
107、中国科学院大学环境科学与工程学院
108、中国科学院大学核科学与技术学院
109、中国科学院大学材料科学与工程学院
110、中国科学院大学化学与化工学院
111、中国科学院大学机械与运载工程学院
112、中国科学院大学光电科学与工程学院
113、中国科学院大学生命科学学院
114、中国科学院大学物理电子学院
115、中国科学院大学信息与通信工程学院
116、中国科学院大学环境科学与工程学院
117、中国科学院大学核科学与技术学院
118、中国科学院大学材料科学与工程学院
119、中国科学院大学化学与化工学院
120、中国科学院大学机械与运载工程学院
121、中国科学院大学光电科学与工程学院
122、中国科学院大学生命科学学院
123、中国科学院大学物理电子学院
124、中国科学院大学信息与通信工程学院
125、中国科学院大学环境科学与工程学院
126、中国科学院大学核科学与技术学院
127、中国科学院大学材料科学与工程学院
128、中国科学院大学化学与化工学院
129、中国科学院大学机械与运载工程学院
130、中国科学院大学光电科学与工程学院
131、中国科学院大学生命科学学院
132、中国科学院大学物理电子学院
133、中国科学院大学信息与通信工程学院
134、中国科学院大学环境科学与工程学院
135、中国科学院大学核科学与技术学院
136、中国科学院大学材料科学与工程学院
137、中国科学院大学化学与化工学院
138、中国科学院大学机械与运载工程学院
139、中国科学院大学光电科学与工程学院
140、中国科学院大学生命科学学院
141、中国科学院大学物理电子学院
142、中国科学院大学信息与通信工程学院
143、中国科学院大学环境科学与工程学院
144、中国科学院大学核科学与技术学院
145、中国科学院大学材料科学与工程学院
146、中国科学院大学化学与化工学院
147、中国科学院大学机械与运载工程学院
148、中国科学院大学光电科学与工程学院
149、中国科学院大学生命科学学院
150、中国科学院大学物理电子学院
151、中国科学院大学信息与通信工程学院
152、中国科学院大学环境科学与工程学院
153、中国科学院大学核科学与技术学院
154、中国科学院大学材料科学与工程学院
155、中国科学院大学化学与化工学院
156、中国科学院大学机械与运载工程学院
157、中国科学院大学光电科学与工程学院
158、中国科学院大学生命科学学院
159、中国科学院大学物理电子学院
160、中国科学院大学信息与通信工程学院
161、中国科学院大学环境科学与工程学院
162、中国科学院大学核科学与技术学院
163、中国科学院大学材料科学与工程学院
164、中国科学院大学化学与化工学院
165、中国科学院大学机械与运载工程学院
166、中国科学院大学光电科学与工程学院
167、中国科学院大学生命科学学院
168、中国科学院大学物理电子学院
169、中国科学院大学信息与通信工程学院
170、中国科学院大学环境科学与工程学院
171、中国科学院大学核科学与技术学院
172、中国科学院大学材料科学与工程学院
173、中国科学院大学化学与化工学院
174、中国科学院大学机械与运载工程学院
175、中国科学院大学光电科学与工程学院
176、中国科学院大学生命科学学院
177、科学技术部直属研究机构
